un grand merci @Arre
un peu de recul, et hop la solution saute à nos yeux 
J’ai 2 répertoires : htdocs/core/modules/facture/doc/
un dans /var/www/html/dolibarr/
un dans /usr/share/dolibarr/
En mettant dans le bon répertoire, ça marche mieux 
Effectivement la procédure Create_a_pdf fonctionne bien et sans insérer manuellement le template dans la table llx_document_model
Merci beaucoup
