Je ne sais pas votre volumétrie de factures à destination des administrations, mais il est tout à fait possible de déposer des PDF non signés sur le portail Chorus Pro manuellement (il y a une reconnaissance à partir du PDF pour pré-remplir certains champs).
Sinon, il est possible de s’équiper d’un module permettant l’automatisation du dépôt via l’API Chorus. Il y a des solutions disponibles sur le Dolistore 
)
